Una classe d'enzims que degraden les molècules d'ADN o ARN pels bons fosfo-diester que tenen enllaços al costat de nucleòtids d'adhesió. a deoxyribonuclease (DNase), el substrat és l'ADN. En format per endonucleases, es trenca a llocs interns en la molècula de substrat. Exonucleasa trenca progressivament des de finals de la molècula de substrat. a ribonuclease (l'ARNasa), el substrat és RNA. Nuclease en S1, el substrat és ADN o ARN monocatenari. Nucleases tenen diferents graus d'especificitat de la seqüència de base, el més específic que les endonucleases de restricció.