Eine Aminosäure-Sequenz, die in ein Protein um seine Reinigung zu erleichtern entwickelt hat. Diese können in verschiedener Weise arbeiten. Dem Tag könnte ein anderes Protein, die an irgendein anderes Material ermöglicht sehr eng und damit das Protein bindet, durch Affinitäts-Chromatographie (q.v.) gereinigt werden. Dem Tag könnte eine kurze Aminosäuresequenz, die von einem Antikörper erkannt wird. Der Antikörper würden dann an das Protein binden, während es es bisher nicht getan hätte. Eine solche kurzen Peptid, Flagge, genannt wurde konzipiert, so dass es besonders leicht, Antikörper gegen sie zu machen. Dem Tag könnte einige Aminosäuren, die dann, als chemische Tag auf dem Protein verwendet werden. Z. B. eine Zeichenfolge von positiv geladenen Aminosäuren sehr stark negativ geladenen Filter gebunden wird: als Grundlage für ein Abscheidesystem verwendet werden könnte. Aminosäuren binden Metalle sehr stark, vor allem in Paaren: Diese chemischen Eigenschaft kann genutzt werden, mithilfe eines Filters mit Metallatome chemisch gebunden drauf, um ein Protein, das aus einer Mischung von Proteinen zu ziehen.