O formă de VNTR (q.v.) în care unităţile repeta (q.v.) de obicei variază de la 10 la 100 baze. Acestea sunt, de obicei, detectate de hibridizare Southern (q.v.), folosind o sondă care cuprinde o clona a unității se repetă. ADN-ul prima amprentele digitale (q.v.) au fost minisatellites detectat în acest fel. Minisatellites tind să fie situate la capetele de cromozomi şi în regiunile cu o frecvenţă ridicată de recombinare.