編碼的序列，例如，在特定基網站多態性 (q.v.) 在基地 306 中一個特定的基因，一個個體可能是雜合性為 A 和 g 的產婦的等位基因: 可能有 A 在此網站，雖然父親的等位基因在此網站有 G。這種類型的多態性是廣泛的整個基因組，並正在探測無需凝膠電泳，打開大型自動化的基因分型的方式的極大優勢。